我院建于1960年,是全国第二批成立的高等中医药本科院校，硕士学位授权单位。经过50年的建设，我院现已发展成为以本科教育为主，开展研究生教育和对外教育的高等中医药院校,为云南省培养出各类型、各种层次的中医药专门人才3万余人。
2007年12月，教育部对我院进行了本科教学工作水平评估，最终结果为“优秀”。
目前，我院成为国家中医药管理局民族医学、中医男科学、中医肾病学、中医痹病学、中医老年病学、中医心理学等中医药继续教育基地。同时，我院及我院第一附属医院（云南省中医医院）还是国家中医药管理局城市社区中医药知识与技能培训示范基地。
2009年3月1日,我院院本部整体成建制地入驻呈贡校区办学，是我省昆明地区第一所整体入驻呈贡办学的高校。
目前，我院有白塔、呈贡两个校区，总面积800余亩，建筑面积共计20余万平方米。呈贡校区为学院院本部。
我院呈贡校区建设力求较好地满足师生学习、工作、生活和管理的功能需求，在设计中紧扣中医药学科和学院的历史与特点，充分汲纳现代文明特征，赋予高等教育功能，选取“秦砖汉瓦、汉唐风格、博士帽檐、天圆地方”的特征作为建筑设计元素，采用“柔、透、秀”的建筑手法，通过“连廊、楼、亭、榭、景”衔接联系各建筑单体，建成各具特色、相互呼应、整体协同的建筑群。
在校园布局和文化特征上，正大门的五行五色大地广场与科技信息大楼内的阴阳太极图处于学院大门中轴线，象征着中医药传统文化及理论的核心阴阳五行学说是学校学术发展的主体及历史传承；在校园人工湖中，建成葫芦岛，寓意着“悬壶济世，大医精诚”是中医药学家的医德、医风、医业之精髓。
整个校园力求中国传统文化与中医药科学内涵相融合，继承传统与发展创新相统一，立足现代与面向未来相统一，建筑风格与人文精神相统一，办学功能与育人环境相统一；具有现代大学校区的功能特质，又成为呈贡新城建设的一个靓丽景观。
我院始终坚持以中医药学科为主体，发掘和建设民族医药特色学科，支持学科间的融合与渗透，积极发展相关学科；现有涵盖医学、理学、工学、管理学等4个学科门类的本科专业15个、专科专业9个。其中，中药学、中医学为国家级特色专业；中医学、制药工程、针灸推拿学和中西医临床医学为省级特色专业。有国家教学质量工程项目2个、省级教学质量工程项目35个。我院1986年获硕士学位授予权。现有一级学科中医学、中药学、中西医结合硕士学位授权点3个，二级学科硕士学位授权点16个。设有中药学院、基础医学院、临床医学院、社科部、公共课程部、研究生部、成人教育学院等7个教学机构。
我院始终坚持以中医药学科为主体，发掘和建设民族医药特色学科，支持学科间的融合与渗透，积极发展相关学科；现有涵盖医学、理学、工学、管理学等4个学科门类的本科专业15个、专科专业9个。其中，中药学、中医学为国家级特色专业；中医学、制药工程、针灸推拿学和中西医临床医学为省级特色专业。有国家教学质量工程项目2个、省级教学质量工程项目35个。我院1986年获硕士学位授予权。现有一级学科中医学、中药学、中西医结合硕士学位授权点3个，二级学科硕士学位授权点16个。设有中药学院、基础医学院、临床医学院、社科部、公共课程部、研究生部、成人教育学院等7个教学机构。
目前，我院有各类别各层次在校学生8000余人。其中：在校日校本专科生5000余人；硕士研究生362人；成人高等学历教育学生3000余人；留学生（含港澳生）和短期留学生近200人。
目前，全校在职教职工596人。其中，正高级职称43人，副高级职称100人。
我院有一大批高水平专家学者，其中国务院突出贡献专家1人，享受国务院政府特殊津贴专家10人；全国名老中医师带徒指导老师13人；国家教育部医药学类教学指导委员会委员2人；省级有突出贡献专家4 人，享受省人民政府特殊津贴专家4人；云南省名中医、荣誉名中医35人；云南省教学名师4人；云南省中青年学术技术带头人1人、后备人才1人；硕士生导师145人。
我院图书馆纸质藏书50万余册；有15个实验室（分设23个专门性教学实验室），11个科研机构，2个生药标本馆——“滇南本草馆”和“神农本草馆”，1个民族医药展示室。中医药学分子生物学重点实验室和云南民族药现代研究重点实验室为云南省高校重点实验室建设项目，临床技能综合模拟实验中心为云南省实验教学示范中心。
